Os primeiros habitantes da região, na qual se localiza o município de Macaúbas, foram índios pertencentes ao grupo dos tupinaé (ramo dos tupinambás) há centenas de anos. Existem vários sítios arqueológicos em todo o município.
A formação do município começou em meados do século XVII, no lugar 'Coité', quando ali chegaram os primeiros brancos, esses eram bandeirantes que transitavam pelo rio São Francisco em busca de ouro e diamantes. Alguns aí se fixaram, dando início ao povoamento.
Do comércio que os seus fundadores mantiveram e desenvolveram resultou que o povoado se ampliasse até a localidade conhecida por Estiva. Já havia, a esse tempo, no arraial de Coité, uma capela erguida em louvor a Nossa Senhora da Conceição que ficou sendo, até hoje, a nossa padroeira.
Com o desenvolvimento do município, o curato da primitiva capela passou a ser a freguesia de Nossa Senhora da Conceição de Macaúbas, promoção que se deu pela Lei provincial nº 124, de 19 de maio de 1840.
Essas terras pertenciam ao município de Urubu (Rio Branco, hoje, Paratinga) do qual foi desmembrado em 1832 para se constituir município independente, com o topônimo de Macaúbas, por decreto estadual de 06 de julho 1832, que também elevou a sua sede à categoria de vila. O início do seu funcionamento ocorreu a 23 de setembro de 1833.
Elevado à categoria de vila com a denominação de Macaúbas, pelo decreto de 06-07-1832, desmembrado do município de Urubu. Sede na antiga povoação de Macaúbas. Instalado em 23-09-1833.
Distrito criado com a denominação de Macaúbas, pela lei provincial nº 124, de 19-05-1840, subordinado ao município de Urubu.
Pela lei provincial nº 1788, de 30-06-1877, é criado o distrito de São Sebastião e anexado ao município de Macaúbas.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1911, a vila aparece constituída de 4 distritos: Macaúbas, Lagoa Clara, Santa Rita e São Sebastião.
Assim permanecendo nos quadros de apuração do recenseamento geral de 1-IX-1920.
Elevado à condição de cidade com a denominação de Macaúbas, pela lei estadual nº 1761, de 10-06-1925.
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